自分用なのか一般サービス用だか基本的な話が見えないし
サーバー自体をどういうところまで管理できるのか不明です。

ローカルアプリケーションをサーバーにリンケージさせる技術をはなから切り捨てているような感じであり
ココに質問する以前にffmpegなりFCSについて全く調べていないようなので
多分ここでそれなりのレスがあっても
結局設定ができないと予想されます。

従ってffmpeg等に手をださないで
既存のサービス会社と契約するか
FCSなど導入するかしたほうがいいと思います。

探索ワード
「ライブ配信　FLV」「ライブ配信　FLV」「配信　FLV　　ffmpeg」

サービス
http://rakuchin.flvmaker.com/

http://www.youtube.com/
まとめ系サイト
http://www.xucker.jpn.org/keyword/youtube.html
など

とりあえずこうしたところを利用していると
いろいろと見えてくるのがあるはずですから
そっから先にすすんだらどうかと思います。

再利用可能な変換サービスなのであれば
規約に反しない範囲で変換した自分のコンテンツは
他のサーバーに移動できるはずです。
自分で自由に使えるサーバーが無い場合
レンタルサーバーかなんかで帯域が太いプロバイダーのHPスペースかなんかにファイルを移動するというのもてではないでしょうか。
動画は帯域食います。


サーバー構築自体をやりたいならば
FCSを使ってみるほうが良いのではと思います。

あとローカルでの作成で話に出たRIVAも
lgplのffmpegで変換しています。

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